Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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GBX1Q14549 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX1Q14549 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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