Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H2Q13888 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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