Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP1A4Q13733 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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