Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SCGB2A2Q13296 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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