Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
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