Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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IFT88Q13099 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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IFT88Q13099 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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IFT88Q13099 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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IFT88Q13099 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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IFT88Q13099 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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