Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NFX1Q12986 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NFX1Q12986 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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