Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FOXD4Q12950 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FOXD4Q12950 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FOXD4Q12950 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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FOXD4Q12950 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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FOXD4Q12950 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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FOXD4Q12950 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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FOXD4Q12950 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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FOXD4Q12950 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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