Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PTPRJQ12913 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PTPRJQ12913 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PTPRJQ12913 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PTPRJQ12913 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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