Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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CHD3Q12873 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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