Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIF5AQ12840 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms