Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms