Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PLOD1Q02809 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms