Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COG7P83436 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COG7P83436 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COG7P83436 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms