Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms