Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms