Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVDP53602 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVDP53602 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MVDP53602 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MVDP53602 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MVDP53602 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MVDP53602 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms