Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD97P48960 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD97P48960 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CD97P48960 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD97P48960 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD97P48960 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD97P48960 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD97P48960 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD97P48960 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CD97P48960 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD97P48960 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD97P48960 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD97P48960 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD97P48960 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD97P48960 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD97P48960 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD97P48960 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD97P48960 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD97P48960 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD97P48960 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD97P48960 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD97P48960 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD97P48960 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD97P48960 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD97P48960 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD97P48960 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD97P48960 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD97P48960 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD97P48960 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms