Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTGER3P43115 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.8 ms