Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGP37231 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARGP37231 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGP37231 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms