Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA9P31269 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms