Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CRABP1P29762 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CRABP1P29762 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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