Protein–RNA interactions for Protein: P24666

ACP1, Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACP1P24666 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACP1P24666 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACP1P24666 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACP1P24666 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACP1P24666 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACP1P24666 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACP1P24666 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACP1P24666 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACP1P24666 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACP1P24666 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACP1P24666 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACP1P24666 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACP1P24666 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACP1P24666 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACP1P24666 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACP1P24666 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACP1P24666 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACP1P24666 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACP1P24666 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms