Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP11P24347 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP11P24347 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP11P24347 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP11P24347 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP11P24347 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP11P24347 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP11P24347 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP11P24347 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP11P24347 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP11P24347 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MMP11P24347 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MMP11P24347 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms