Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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