Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL7RP16871 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL7RP16871 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IL7RP16871 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IL7RP16871 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IL7RP16871 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IL7RP16871 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IL7RP16871 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IL7RP16871 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IL7RP16871 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IL7RP16871 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IL7RP16871 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IL7RP16871 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IL7RP16871 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IL7RP16871 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IL7RP16871 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IL7RP16871 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IL7RP16871 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms