Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms