Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TPRP12270 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TPRP12270 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPRP12270 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms