Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf89P0DMQ9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms