Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSP90AB1P08238 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSP90AB1P08238 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms