Protein–RNA interactions for Protein: O75112

LDB3, LIM domain-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB3O75112 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB3O75112 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB3O75112 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDB3O75112 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDB3O75112 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDB3O75112 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDB3O75112 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDB3O75112 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDB3O75112 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDB3O75112 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDB3O75112 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDB3O75112 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDB3O75112 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDB3O75112 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LDB3O75112 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDB3O75112 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDB3O75112 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDB3O75112 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LDB3O75112 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms