Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms