Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms