Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM227AF5H4B4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms