Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA5E9PKD4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms