Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PATL2C9JE40 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PATL2C9JE40 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PATL2C9JE40 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PATL2C9JE40 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PATL2C9JE40 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PATL2C9JE40 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PATL2C9JE40 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PATL2C9JE40 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PATL2C9JE40 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PATL2C9JE40 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PATL2C9JE40 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PATL2C9JE40 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PATL2C9JE40 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PATL2C9JE40 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PATL2C9JE40 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PATL2C9JE40 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PATL2C9JE40 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PATL2C9JE40 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms