Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN25C9JDP6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN25C9JDP6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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