Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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