Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEMP2A6NFY4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms