Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms