Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SCML1Q9UN30 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCML1Q9UN30 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms