Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NDRG4Q9ULP0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms