Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MLH3Q9UHC1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH3Q9UHC1 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms