Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
USP36Q9P275 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms