Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLRF1Q9NZS2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLRF1Q9NZS2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms