Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP6Q9NYH9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP6Q9NYH9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP6Q9NYH9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP6Q9NYH9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UTP6Q9NYH9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP6Q9NYH9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP6Q9NYH9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP6Q9NYH9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP6Q9NYH9 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP6Q9NYH9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP6Q9NYH9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP6Q9NYH9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP6Q9NYH9 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UTP6Q9NYH9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
UTP6Q9NYH9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms