Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCSER1Q9C0I3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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