Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMBRA1Q9C0C7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms