Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CIPCQ9C0C6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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