Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms